Teaching
The following courses are instructed by GiBBS active members:
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Bioinformatics for Omic Science by Andrés Pinzón (2027081) .
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Systems Biology of Metabolism by Andrés Pinzón (2026806).
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Statistical Genomics by Liliana López (2024643): El análisis de datos genómicos hace parte del quehacer diario de la biología y la medicina, especialmente desde la secuenciación de genomas y la aparición de las técnicas de biología molecular que permiten extraer diferentes clases de información del genoma de los organismos de estudio. El objetivo de este curso es que los estudiantes comprendan y puedan analizar diversos tipos de datos genómicos y postgenómicos haciendo especial énfasis en los datos de expresión génica. El curso permitirá adquirir conocimientos básicos de genética y biología molecular, sobre los diferentes tipos de datos genómicos y su análisis para que los estudiantes puedan participar en estudios de biología de sistemas que utilizan los datos genómicos para responder a preguntas biológicas. Luego de una introducción en la cual se repasarán bases de biología molecular y de estadística, se darán indicaciones sobre cómo obtener estos datos en las bases de datos genómicas. El centro de la asignatura será el estudio y aplicación de varios análisis estadísticos para datos genómicos, haciendo énfasis en los datos de expresión (microarreglos y RNA-seq). Los estudiantes también aprenderán a obtener y analizar datos proteómicos, datos de secuencias y datos de polimorfismo de nucleótido simple. Al finalizar el curso los estudiantes tendrán la capacidad de obtener, interpretar y analizar datos genómicos usando diversas librerías de la colección Bioconductor de R, así como otras librerías de R y algunas herramientas web y programas adicionales como, STRING, cytoskape, DAVID, etc.
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Introduction to Machine Learning by Juan D. García.